ubuntu 13.4 не загружается / будет устанавливать ubuntu из usb стереть то, что у меня есть

sudo apt-get install tidy
cd whatever_dir_you_want
find . -name '*.html' -exec tidy -m {} \;

Примечание: это, вероятно, неплохо будет играть с inline-php. Играйте с tidy (без аргумента -m), чтобы увидеть, как это работает.