Как сделать php-файлы, с помощью которых будут отображаться данные MySQL, PHP, phpmyadmin, Apache, Python и т. Д.?

Добавьте эти строки:

# Custom aliases
alias l='ls -a'
alias ll='ls -l'
alias la='ls -la'

в конец ~/.bashrc, например, используя:

nano .bashrc