Что является лучшим, действительно зависит от Ваших потребностей.
Многие люди используют двойную загрузку, таким образом, они могут использовать тот же компьютер с двумя различными Операционными системами, такими как Ubuntu и Windows или OS/X.
В таком случае, 250 ГБ каждый - разумная начальная настройка. При использовании Windows загрузите его сначала, затем заставьте Ubuntu делить диск. Будьте готовы экспериментировать немного.
, Если Вы просто хотите использовать компьютер для Ubuntu, используйте целый диск. Можно все еще использовать другую Операционную систему в VM, таком как VirtualBox.