Как автоматически запускать программы в определенных рабочих пространствах при запуске

даже при том, что Вы могли на самом деле записать некоторый сценарий, чтобы автоматически запустить какое-либо приложение, Вы хотите в различном X сессий, можно ли хотеть взглянуть на файлы конфигурации wm (который является?).

чтобы сделать точно, что Вы спросили, например, с xmonad (мой wm), просто необходимо записать несколько строк, как

className =? "Icedove"             --> doShift "3:mail"

если Вы используете compiz, я думаю, что существует плагин для помещения приложения в определенную рабочую область. таким образом, все, что необходимо сделать, должно просто автоматически запустить их.

поэтому укажите свой wm :)