экспортировать пакеты dist-upgrade в файл

Если внешние источники являются PPA, вы можете просто добавить их на вкладку Третьей стороны. Если вы компилируете исходный код или загружаете случайные файлы .deb из Интернета (не с страницы PPA или Debuntu или Medibuntu, у которых есть полный репозиторий), тогда диспетчер обновлений не может их обрабатывать.