Я плохо знаком с Ubuntu, и я в настоящее время выполняю ее на Oracle VM VirtualBox для работы с программным обеспечением под названием Xmipp (больше деталей о программном обеспечении на http://xmipp.cnb.csic.es/twiki/bin/view/Xmipp/WebHome).
Теперь, я следовал руководству HowToInstall, которое сначала требует, чтобы я загрузил Двоичные файлы Linux (Ubuntu) с этой ссылки. И затем, как упомянуто на ссылке HowToInstall, я выбрал
Опция 1:Using Предварительно скомпилированные двоичные файлы
и выполняемый install_binaries.sh сценарий. Я затем иду следующее сообщение:
> #!/bin/bash ID=$$ cat .xmipp.bashrc |grep XMIPP_HOME= |cut -d "=" -f 1 |sed -e "s/XMIPP_HOME/XMIPP_HOME=$(pwd | sed -e 's/\//\\\//g')/g" >
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} && cat $(pwd)/.xmipp.bashrc |egrep -v
> ".xmipp.cfg|XMIPP_HOME=|^#" >> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} &&
> echo "test -s $(pwd)/.xmipp.cfg && . $(pwd)/.xmipp.cfg || true" >>
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} && mv
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} $(pwd)/.xmipp.bashrc && source
> $(pwd)/.xmipp.bashrc && echo 'Xmipp3.0 binaries have been succesfully
> installed in your system. Please, put a source to .xmipp.bashrc file
> in your .bashrc file. Just for this session, .xmipp.bashrc has been
> already sourced, so if you executed the install_binaries.sh script
> with source or . changes will be applied to this shell and so, you
> should be able to execute xmipp from this terminal. If you did it with
> ./install_binaries.sh its time to source .xmipp.bashrc manually to
> have xmipp working in this shell session.'
Так как в сообщении говорится, что двоичные файлы Xmipp 3.0 установлены, я затем переходил к этой ссылке и следовал инструкциям, упомянутым под
Запущение тестов библиотеки (дополнительный, но рекомендуемый)
Теперь это - часть, где я нахожу трудным следовать инструкциям, потому что авторы упоминают это
можно запустить тесты путем выполнения (из корневого каталога Xmipp) команды:
xcompile gtest=yes run_tests
Теперь я загрузил Xmipp 3.0 как файл со следующим именем Xmipp-3.1-linuxbin-all-x86_64.tar.gz и извлек его на мой рабочий стол. Поэтому я перешел к терминалу и записал
cd ~/Desktop/xcompile gtest=yes run_tests
Но затем я иду при ошибочном высказывании bash: cd: /home/shrey/Desktop/xcompile: No such file or directory
. Мог объяснить, что является мной делающий неправильно и как может я заставлять Xmipp работать над Ubuntu.
Последняя версия Xmipp была выпущена под более общими рамками, Scipion (www.scipion.cnb.csic.es), который позволяет Вам комбинировать несколько пакетов EM (таких как Xmipp, Паук, Relion, Eman2, и т.д.) в Вашем проекте. Таким образом, мы настоятельно рекомендуем Вам установить lastest версию Xmipp 3 через Scipion. В следующей ссылке можно найти подробные инструкции для процесса установки:
https://github.com/I2PC/scipion/wiki/How-to-Install
Некоторые учебные руководства могут быть найдены в:
https://github.com/I2PC/scipion/wiki
Hope это помогает, Jose Miguel