Если вы отредактировали свой файл crontab с помощью редактора Windows (через samba или что-то еще) и заменили строки с помощью \ n \ r или просто \ r, cron не будет запущен.
Кроме того, если вы используете /etc/cron.d/*, и один из этих файлов имеет в нем \ r, cron будет перемещаться по файлам и останавливаться, когда он попадает в плохой файл. Не уверен, что это проблема?
Использование:
od -c /etc/cron.d/* | grep \r