У сайта поддержки ubuntu есть эта полезная страница, если вы хотите избавиться от нее ... Как полностью удалить и переустановить Ubuntu One? Просто не переустанавливайте, я думаю
Я думаю, вы должны использовать uget, он может обрабатывать магнитную ссылку, а также файлы .torrent, это небольшое и очень аффективное приложение для Ubuntu.