Чтобы сделать оригинальный ответ немного понятным для других людей:
В Ubuntu 13.04 (также должен работать и в 12.10), только с установленными заголовками ядра вы можете сделать это:
sudo ln -s /usr/src/linux-headers-$(uname -r)/include/generated/uapi/linux/version.h /usr/src/linux-headers-$(uname -r)/include/linux/version.h
Я должен делать это каждый раз, когда я обновляю ядро прямо сейчас.