libjvm.so: не может открыть файл общего объекта: Никакой такой файл или каталог

Попытка установить rJava пакет на R, на моих 14,10 человечности, использование этого кода

if (!require(rJava)) install.packages('rJava')

получил немного ошибок, связанных с Java включая jni проблемы, после переустановки jdk, и попытался выполнить тот же код снова, получил ту ошибку

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/rJava’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpfFjrp0/downloaded_packages’
Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘rJava’

разыскиваемый решения, для нахождения примерно всех предложением (для x64) для выполнения тех команд

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
sudo R CMD javareconf 

но это не работало, там что-либо еще, что я могу сделать? Я предоставлю любую необходимую подробную информацию, и поиск libjvm.so на всей машине привел к этому

/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/jdk1.8.25/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/local/java/jre1.7.0_75/lib/amd64/server/libjvm.so
7
задан 29 August 2017 в 01:57

3 ответа

Выполнение следующего должно решить Вашу проблему:

$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
$ sudo R CMD javareconf
10
ответ дан 23 November 2019 в 06:19

Шаги:

  1. Находят Ваше местоположение R. Это будет сохранено в rsession-ld-library-path в rserver.conf файл. Или только путем выполнения which R. Местоположение обычно /usr/lib64/R/lib, или /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib

  2. Находят libjvm.so файл, который обычно находится в эти usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server путь, в зависимости от которого jre Вы используете. Проверьте echo $JAVA_HOME.

  3. Создают символьную ссылку с помощью ln -s sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib/libjvm.so

  4. Перезапуск R сервер

2
ответ дан 23 November 2019 в 06:19

Иногда Вам нужно, это R CMD javareconf -e

видит https://stackoverflow.com/a/13446026/2803344

1
ответ дан 23 November 2019 в 06:19

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: