Я открыл файл PDF в xournal и отредактировал его с помощью стилуса. После сохранения как xournal файл, с .xoj расширением, я выбрал экспорт как .pdf из меню файла.
Когда я пошел для открытия нового файла в средстве просмотра PDF и в xournal, все, что было видимо, были метки редактирования, которые я сделал, и ни один из оригинала документа.
Я использую человечность 16.04.
Вместо того, чтобы открыть файл pdf непосредственно, я выбрал, "аннотируют PDF" из меню файла. Это открыло диалоговое окно, которое позволило мне выбирать файл для редактирования. После того, как сделанный, экспортируя, поскольку .pdf привел к полному файлу - исходный и редактирование - чтобы быть просмотренным.
(Оставляющий это здесь в случае, если кто-либо еще натыкается на эту проблему.)