Хотя ваша основная проблема уже ответила, похоже, что вы получаете предупреждения debconf, потому что вы используете apt-get без интерактивного tty. Чтобы избавиться от этих сообщений, вы можете установить эту переменную среды:
DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
Чистая установка Netbeans в Ubuntu написана в командной строке: sudo apt-get install netbeans. Он установит версию 7.0.1, но это лучше, чем ничего.