На этот вопрос уже есть ответ:
I хотел бы запустить Skype в фоновом режиме при запуске. Я установил Skype с программным обеспечением, включенным в Gnome 16.04.
Мне удалось добавить его в автозагрузку, но я не знаю, как избежать открытия окон. Я просто хочу, чтобы он работал в фоновом режиме.
Спасибо за вашу помощь!
Для запуска, скайп в фоне переходят в tools->settings
и включите Launch Skype in the background
(значение по умолчанию выключено).
И если Вы хотите значки в главной панели, можно установить расширение гнома TopIcons Плюс который перемещения все значки панели задач (левая нижняя часть Gnome Shell) к верхней панели.