Меню в строке заголовка окна

Это ожидаемое поведение. У вашего пользователя root нет полного набора настроек gnome, и было бы неплохо, если бы он автоматически подключался к smb-ресурсам. В этом направлении безумие.

Корневой nautilus предназначен только для использования с вашими системными файлами. Это не означает, что вы используете его для подключения к сетевым ресурсам или открытия файлов с помощью приложений. Оба из них предлагают огромные проблемы с безопасностью.