Скрипт запуска можно запускать несколько раз, несмотря на файл pid

Это зависит от того, что вы подразумеваете под «совместимостью». Если вы имеете в виду родную версию, маловероятно, что она будет создана из-за аргументов доли рынка, сделанных @sunpech.

Вам было бы лучше спросить, как запустить Starcraft 2 на Ubuntu. Из базы данных приложений вина:

http://appdb.winehq.org/objectManager.php?sClass=version&iId=20882

похоже, что ее можно запустить достаточно хорошо в вине. Вы должны попробовать запустить его в вине.