Checking for gcc [ok]
Extract gcc version 5.4
Checking for OpenMP activation [disable]
Extract CPU architecture: 64 bits
Looking for specific library directories for 64 bits [ko]
Checking for lapack [ko]
Checking for blas [disable]
Checking for gslcblas [disable]
Checking for gsl [disable]
Checking for fftw3f [ko]
Configuration failed
Для меня кажется, что необходимо установить некоторые пакеты разработки с заголовками:
sudo apt-get install liblapack-dev libfftw3-dev
Я нашел это пакетами с поиском на https://packages.ubuntu.com.