Мое предложение - использовать yad, являющийся вилкой Zenity.
Установка:
sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/y-ppa-manager
sudo apt-get update
sudo apt-get install yad
Узнайте о yad:
man yad
Это не идеальное решение, но yad является мощным и гибким, и у него есть тайм-аут.