Если, как и я, вы вынуждены sudo eclipse, потому что вы сделали это когда-то из отчаяния, что изменило какой-то конфигурационный файл как root и надолго укоренил вас в Sudoland для Eclipse. Вы можете попробовать:
sudo chmod -R a+rwx ~/workspace
sudo chmod -R a+rwx ~/.eclipse
, который вывел меня из него.