Изменения в файлах не могут быть обнаружены

Это было долгое время, что на моем ноутбуке, мерзавец или мегасинхронизация не могут обнаружить изменение на файлах. Они видят новые файлы, но не измененные файлы. Файловая система смонтирована как: /dev/mapper/vgroot-lvroot on / type btrfs (rw,relatime,ssd,space_cache,subvolid=523,subvol=/@root)

/tmp$ mkdir test; cd test
/tmp/test$ git init
Initialized empty Git repository in /tmp/test/.git/
/tmp/test$ touch a
/tmp/test$ git stage a
/tmp/test$ git commit -a -m 'a'
[master (root-commit) ea2464b] a
 1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
 create mode 100644 a
/tmp/test$ stat a
  File: 'a'
  Size: 0               Blocks: 0          IO Block: 4096   regular empty file
Device: 17h/23d Inode: 12931371    Links: 1
Access: (0644/-rw-r--r--)  Uid: (SOMETHING)   Gid: (SOMETHING)
Access: 2016-11-07 19:55:44.945089596 +0800
Modify: 2016-11-07 19:55:44.945089596 +0800
Change: 2016-11-07 19:55:44.945089596 +0800
 Birth: -
/tmp/test$ vim a
/tmp/test$ stat a
  File: 'a'
  Size: 4               Blocks: 8          IO Block: 4096   regular file
Device: 17h/23d Inode: 12931371    Links: 1
Access: (0644/-rw-r--r--)  Uid: (SOMETHING)   Gid: (SOMETHING)
Access: 2016-11-07 19:56:04.804211299 +0800
Modify: 2016-11-07 19:56:06.980224918 +0800
Change: 2016-11-07 19:56:06.985224949 +0800
 Birth: -
/tmp/test$ git status
On branch master
nothing to commit, working tree clean