К сожалению, насколько мне известно, еще нет возможности сделать это.
Я положил это в ответ, чтобы вы могли его принять.
Проблема с пакетом desktop-base, который устанавливает некоторые темы plymouth и другие вещи.
You не нужно использовать gnome-shell, поскольку это зависит только от пакета gnome, поэтому вы можете безопасно удалить его, и логотип вернется, как обычно.