Лично мне нравится использовать Synaptic. Это заставляет меня чувствовать себя более уверенно в том, что происходит. Единственное приложение, которое я использовал, которое имеет возможность удалить старые ядра, - Ubuntu Tweak.
Как удалить ядра, которые вы не используете:
Открыть UbuntuTweak Нажмите «Очистить пакет» 'в разделе «Приложения» в левой панели. В правой части «очистки» нажмите «Очистить ядра». Выберите все ядра. Я думаю, что тот, который используется, отсутствует в списке, но на всякий случай проверьте работу uname -a в терминал