Просто используйте сценарий Nautilus-Action для реализации этого.
Установите gksu и nautilus-действия из Software Center. Затем откройте инструмент настройки Nautilus-Action
в Nautilus-Action Инструмент настройки создайте новое действие. На вкладке «Действие» введите «Open Folder As Root» в метке Context. На вкладке «Command» введите значения «gksu» и «nautilus %d/%w» в «Путь и параметры команд» соответственно. Затем перезапустите nautilus: nautilus -q
Похоже, у вас проблемы с зависимостью после установки mate. Попробуйте эти команды и посмотрите, помогает ли это:
sudo apt-get -f install
sudo apt-get --configure -a
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo update-grub