Ubuntu Studio 20.04, оконный менеджер XFCE.
Такое поведение началось где-то в последние месяцы. Как только курсор мыши окажется за пределами активного окна, ввод с помощью колеса прокрутки активирует окно под курсором и выведет его наверх.
Раньше события прокрутки переходили в окно под курсором, но не отбирали фокус у активного окна. Это желаемое поведение. Теперь это крадет фокус.
Это настройка режима фокусировки, хотя она предназначена для Gnome, возможно, она не применима:
$ gsettings get org.gnome.desktop.wm.preferences focus-mode
'click'
Это настройки фокуса настроек оконного менеджера XFCE: