Пока вы не сказали панели «удалить» апплет часов, вы сможете вернуть его с помощью простого перезапуска самой панели gnome. Просто нажмите Alt-F2, затем запустите:
killall gnome-panel
Это перезапустит панель и перезагрузит ваши часы.
Если вы удалили апплет часов, вам придется повторно примените его. Щелкните правой кнопкой мыши на пустой области панели, щелкните правой кнопкой мыши и выберите «Добавить в панель». Затем найдите и выберите апплет «Часы», затем нажмите кнопку «Добавить» внизу.
Этот ответ основан на подсказке, которую Рмано дал в конце своего ответа, хотя метод списка контроля доступа к файлу не работал.
Это не сработало, потому что полный путь, например /path/to/dir требует, по крайней мере, разрешения на чтение + выполнение: sudo chmod -R g+rx /path. Это решило мою проблему, и теперь я могу получить доступ к символической ссылке в домашнем каталоге A и записать в содержащиеся файлы.