Как я временно решил проблемы, это переключить клавиатуру и мышь обратно на USB-концентратор экрана и перезагрузить компьютер, после чего проблема исчезла. Однако, если кто-то еще столкнется с более элегантным решением, они могут дать еще один ответ. Это в основном только для тех, кто сталкивается с той же проблемой и хочет быстро исправить.
Обычная проблема с Gnome, это гном-ориентированный или GTK-ориентированный. Если Qt-программы хороши в Gnome, для Qt, а не для Gnome.