Просто для обновления, поведение изменилось сейчас. Skype представила облачный сервис, который будет хранить автономные сообщения, если обе стороны имеют облачный клиент. К сожалению, я ожидаю, что любой клиент Linux не облачно включен. См. Также здесь: Будет ли отправлено мое мгновенное сообщение, если получатель не подписан в Skype?