попытка копирования из root в пользователь

Если вы установили пакеты, загрузив их вручную и установив их, вы получите такие конфликты. Зачем? Поскольку APT может «видеть» пакеты в репозиториях. Вы решили установить только определенный набор пакетов ранее, а теперь, когда вам нужен другой, он будет видеть только один из основных хранилищ Ubuntu.

Исправить это и установить LibreOffice таким образом, чтобы вы получите обновления, я предлагаю вам установить PPP LibreOffice 4.1.

sudo apt-add-repository ppa:libreoffice/libreoffice-4-1

sudo apt-get update && sudo apt-get dist-upgrade

См. также Есть ли PPA с последней версией LibreOffice?