Чтобы подсчитать файлы (даже файлы без расширения) в корневой папке текущего каталога, используйте:
ls -l | grep ^- | wc -l
. Чтобы подсчитать файлы (даже файлы без расширения) рекурсивно из корня текущего каталог, использование:
ls -lR | grep ^- | wc -l