Это не замедлит работу вашего компьютера, потому что вы не стреляете в него все вместе:)
Тот факт, что только одна операционная система будет работать в настройках с двойной загрузкой, аппаратные ресурсы, такие как CPU и память не используется в обеих операционных системах (Windows и Linux), поэтому в текущей операционной системе используется максимальная аппаратная спецификация. Что касается проблемы с диском, хорошо, если в разделе Windows не осталось свободного места, которое в конечном итоге можно устранить, удалив некоторые файлы.