Я просто обновился до Oneiric Ocelot, и проблема, которая уже присутствовала в Natty, ухудшилась - аудио и видео не синхронизируются как в VLC, так и в mplayer. Проблема была только в VLC в Natty.
Некоторые поиски в Интернете, по-видимому, указывают на то, что проблема с импульсом может быть проблемой.
Я следовал этим инструкциям и отлично работал:
http://www.st4ck.com/it/post/ubuntu-11-04-vlc-out-of-sync/#Runtime
Вы тестировали изменение Caching Value в настройках (ctrl + p, затем Show settings: all). Если вы используете NAS в качестве медиафайла, вы должны изменить его в SMB Access Module.
] Проверьте настройку на 0, если вы читаете файл с вашего жесткого диска.