На панели управления клавиатурой вы можете настроить несколько раскладок клавиатуры на вкладке Layouts. Нажмите Options... и разверните раздел Key(s) to change layout. Выберите комбинацию клавиш, которую вы предпочитаете, и у вас должен быть простой способ переключения макетов.
Если флажок Separate layout for each window установлен на панели управления главной клавиатурой, то каждое окно должно помнить, какой макет они используют отдельно а не глобальным.