Как я могу получить все мои каталоги GMail в Thunderbird?

Как вы говорите, флажок там отсутствует, я предполагаю, что вы находитесь в правильном месте, чтобы изменить его в Thunar, поэтому, если флажок в Properties -> permissions не существует, это потому, что файл не является исполняемым файлом (if это сценарий, включили ли вы #!/bin/bash в начале?)

Если флажок установлен, и вы не можете его изменить, это потому, что вы не можете изменить файл (не являетесь владельцем ?).