Будет ли Node.js влиять на мою установку сервера LAMP?

Вы убедились, что запись в записи вашего локального компьютера /home/user/.ssh/id_rsa.pub (машина, с которой вы пытаетесь SSH) скопирована правильно в файл /home/user/.ssh/authorized_keys пользователя сервера SSH? Он должен быть скопирован полностью правильно, чтобы система распознала его как на локальной системе, так и на удаленном сервере (на сервере, к которому вы пытаетесь подключиться к SSH)