(конвертированный комментарий OP для ответа)
Пока я искал способ изменить место появления уведомлений, я наткнулся на настройки в dconf.
Если вы перейдете в com, затем канонический, затем индикатор, а затем в звук вы найдете возможность изменить порядок разных записей в звуковом меню.
Насколько я знаю, он ищет ~ / Music и ~ / Video для этих объективов.
Простейшее и наиболее очевидное решение - это привязка этих папок ко второму жесткому диску.
Более сложное решение включает пользовательские линзы.