Если это сценарий оболочки, вы можете «исправить» его из другого сценария оболочки, то есть:
#!/bin/bash
# This script runs another script indirectly, by sucking in its contents and evaluating inline:
source /path/to/script/which/lost/its/exec/flag "$@"
«$ @» добавляет параметры командной строки, если это необходимо.
Сказав это, это, вероятно, не лучшее решение для основной проблемы, но мы недостаточно знаем об этой проблеме, чтобы предложить альтернативы.
Вы можете добавить эту команду в свою функцию .bashrc как функцию или псевдоним и выполнить эту функцию или псевдоним с помощью оператора &&.
Другими словами ./pythonscript.py && aliasToChMod [!d1 ]