Если вы что-то вроде SPSS, в частности, вы можете попробовать GNU PSPP, который упакован в Ubuntu. Он стремится оставаться совместимым с командным языком SPSS и форматами данных, но не поддерживает все команды SPSS.
Если это не подходит для того, что вы хотите сделать, я бы предложил посмотреть на R как на другое ответы предложили.