При создании пакета deb, могу ли я зависеть от файла, а не от пакета

Если ваши данные были разделены запятой, ваша операция будет намного проще:

kmcet@ubuntu:~$ cat data.txt
123,456
123,789
123,567

kmcet@ubuntu:~$ cut -d, -f1,1  data.txt
123
123
123