Это всего лишь обходной путь для реальной проблемы, но есть комбинация клавиш для минимизации окон, Alt + F9
Он закрывает только активное окно, хотя и не все окна приложения.
Этот один и многие другие сочетания клавиш, однако, настраиваются с помощью клавиш gnome-keybinding-свойств приложений с ярлыками клавиатуры. Это часть приложения системных настроек, которое можно запустить через меню выхода из правой части панели.
Я использую это, например, чтобы заблокировать экран с помощью кнопки паузы на моей клавиатуре.