Программный центр - это всего лишь интерфейс для aptdaemon, который является службой управления пакетами на основе транзакций. Он ведет себя так же, как apt-get, который считывает текущую архитектуру. Если вы выберете пакет для установки, он проверит текущую архитектуру и установит ее.