Как очистить темы / значки, которые я испортил

Вы можете переустановить пакет, открыв терминал (Alt + Control + T) и используя

sudo apt-get install --reinstall nameofpackage 

(заменив nameofpackage на имя вашего пакета).

Если вы предпочитаете графический интерфейс для расширенного управления пакетами, сделайте себе одолжение и нажмите Software Center - используйте надлежащий менеджер пакетов, такой как Synaptic или Muon, который позволяет вам переустанавливать пакеты, или вы можете использовать ncurses-based Aptitude в командной строке.