cd ~/.local/share/applications - это первое место, где вы смотрите.
Примеры из моего каталога, который я использовал для добавления списков быстрого доступа:
~/.local/share/applications$ ls banshee.desktop gnome-terminal.desktop chromium-browser.desktop mimeapps.list firefox.desktop nautilus-home.desktop gedit.desktop ubuntu-software-center.desktop