Вы можете сделать это со ссылкой и с изменением конфигурации proftpd.
Создать ссылку с /home/ftp/bob на /var/magicaldir
ln -s /var/magical otherdir
Затем отредактировать /etc/proftpd/proftpd.conf, найдите и закомментируйте директиву link .
#Defaultroot ~
Сохраните файл и перезапустите proftpd.