Предположительно ldconfig вызывается где-то, а libXinerama.so.1.0.0.back сортируется после libXinerama.so.1.0.0, поэтому он выбирается как самая новая версия библиотеки.
Почему именно вам нужно сначала исправить клиентскую библиотеку расширения Xinerama?