Этот элемент конфигурации перемещен в систему gsettings. Вы должны иметь возможность установить новое значение конфигурации с помощью:
gsettings set org.gnome.desktop.interface can-change-accels true
Если вы предпочитаете графический инструмент для изменения этих параметров, попробуйте установить пакет dconf-tools, чтобы получить инструмент dconf-editor.