Как изменить размер шрифта для цифровых часов lxpanel?

Вы не можете изменить это поведение.

Верхняя часть предназначена для пользовательских элементов запуска, в основном ярлыков, нижняя часть предназначена для объективов, таких как линзы Applications и Files & Folders которые установлены по умолчанию, и есть элементы запуска Trash, которые фиксированы в самом низу запуска.

Однако вы можете настроить положение каждого элемента в своей группе.