Я не думаю, что .xinitrc выполняется диспетчером дисплея. Вы пробовали с .xprofile? Здесь приводится другая проблема: https://wiki.ubuntu.com/X/Config/Resolution
Я часто использую небольшую команду zenity в этих файлах, чтобы подтвердить, что они эффективны , как
zenity --warning --text "I am in .xprofile and I RUN\! " &