Это довольно простая проблема. Я считаю, что Linux помещает ваш разъем для наушников в состояние, которое Windows не может распознать.
Я обнаружил, что выполнение холодного отключения (удерживая кнопку питания в течение 10 секунд) Linux, а затем загрузка в Windows часто устраняет эту проблему.