Вот что я хотел бы попробовать (и использовал в прошлом):
Установите arandr из Software Center или набрав sudo apt-get install arandr в окне терминала. Запустите arandr, набрав его в тире Unity. Вы должны увидеть графику, показывающую оба монитора. Вы можете перетащить их в любое относительное положение, а также установить разрешение каждого из них. (У меня нет второго монитора здесь, но вы должны иметь возможность получить представление об этом снимке экрана.
Похоже, у вас одна очень занятая (не многопоточная) программа, которая занимает один процессор. Уверен, вы обнаружили один процесс с почти 100% нагрузкой на процессор в ненормальном состоянии («почти разбился») - например. Firefox с множеством открытых вкладок и мощью сосания JavaScript. Запуск ps aux на консоли должен дать вам преступника. Этот процесс также может быть вызван постоянным увеличением потребления памяти. Большинство других процессов более или менее хорошо распределены на других процессорах, что дает вам 10-20% нагрузки.
Это возможно, только если программа разрешает многопоточность. Если сама задача поддерживает мулити-потоки, то ее нельзя распараллелить. Например, метод Ньютона-Рафсона
Но ваш процессор в основном не использует одно и то же ядро каждый раз, но выбирает один из ядер случайным образом для программы. Например, время, другое ядро достигает 100%, когда программа запускается каждый раз.
График системного монитора: