Существуют ли какие-либо программы по умолчанию в Ubuntu 16.10, которые берут мои данные и создают риск конфиденциальности?

Решение, которое я искал, находится в /etc/environment, который, как указано в EnvironmentVariables, не обрабатывает скрипты и не расширяет переменные, поэтому добавление следующего (без экспорта) выполнило трюк:

JAVA_HOME=/opt/java/jdk1.8.0_05

Затем я перезагрузил систему, чтобы изменения вступили в силу.