У меня была такая же проблема в natty, когда Unity не загружался, но после того, как я сделал решительный шаг и установил драйверы ATI fglrx, проблема исчезла полностью. Не уверен, что это поможет вам с gnome 3, но, возможно, стоит попробовать
Я сделал это с помощью терминала с
sudo apt-get install fglrx
По какой-то причине я не понимаю, что он исправил мои проблемы с проблемами входа в систему, и у меня была такая же проблема, как и вы, т.е. мне пришлось бы снова войти в систему, чтобы получить рабочий стол, который был (как вы находят) немного раздражающим. [ ! d4]
Я бы предпочел придерживаться драйверов с открытым исходным кодом и не делать каких-либо 3D-материалов, чтобы говорить, но поскольку это исправление работало для меня, я придерживался его.
Дайте нам знать, как вы продолжаете.